1、毛細管電泳儀：其主要部件有0～30kV可調穩壓穩流電源，內徑小于100μm(常用50～75μm)、長度一般為30～100cm的彈性石英毛細管、電極槽、檢測器和進樣裝置。檢測器有紫外／可見分光檢測器、激光誘導熒光檢測器和電化學檢測器，前者zui為常用。進樣方法有電動法(電遷移)、壓力法(正壓力、負壓力)和虹吸法。成套儀器還配有自動沖洗、自動進樣、溫度控制、數據采集和處理等部件。
2、常規電泳儀：其組成部件為可調穩壓穩流電源，垂直電泳槽，水平電泳槽，電極連接線，支持體【非凝膠性支持體區帶電泳 （支持體有： ①淀粉 ②纖維素粉 ③玻璃粉，硅膠等) ；凝膠支持體區帶電泳支持體有： ①淀粉液 ②聚丙烯酰胺凝膠 ③瓊脂（糖）凝膠 】；陶瓷板，抽水泵，輸水管，冰水曹等部件組成。
3、其他電泳儀：Tiselius或微量電泳 、顯微電泳 、等電點聚焦電泳技術 、等速電泳技術 、密度梯度電泳等。是一種非支持體的電泳儀也稱為自由電泳法的發展并不迅速，因為其電泳儀構造復雜、體積龐大，操作要求嚴格，價格昂貴等很少使用。
